Отделение является клинической базой кафедры патологической анатомии СибГМУ. Все врачи и сотрудники лабораторно-технологического звена имеют первые и высшие квалификационные категории, а также участвуют в научно-исследовательской работе.

Прижизненная диагностика по операционному и биопсийному (специально полученному для диагностических целей) материалу занимает более 90% объема работы отделения. Диагностика всех онкологических заболеваний, значительная часть гинекологических, урологических, хирургических, гастроэнтерологических, дерматологических, эндоскопических диагнозов в клиниках СибГМУ основывается на заключениях ПАО.

Проводятся исследования

• всех органов и тканей, полученных при операциях во всех отделениях многопрофильного стационара клиник;
• биопсий шейки матки и соскобов полости матки;
• пункционных биопсий предстательной железы и печени;
• срочных интраоперационных биопсий, определяющих необходимый объем операции;
• эндоскопических биопсий всех основных локализаций: пищевода, желудка, кишки, верхних дыхательных путей, бронхов, мочевого пузыря;
• лапароскопических биопсий;
• кожных и мягкотканных новообразований;
• офтальмологических новообразований;
• лимфатических узлов;
• проводятся консультации готовых препаратов из других лечебных учреждений и дополнительные исследования на материале, полученном в других лечебных учреждениях.

Направления деятельности

• морфологическая диагностика болезней с использованием как классических, так и новейших методов исследования;
• клинико-анатомический экспертный анализ и оценка качества лечения пациентов в стационаре.

Основные задачи

• Улучшение прижизненной диагностики заболеваний с помощью исследований биопсий и операционного материала, включая срочные интраоперационные биопсии;
• Анализ качества диагностической и лечебной работы совместно с лечащими врачами, посредством сопоставления клинических и патологоанатомических данных и диагнозов;
• Обеспечение достоверных данных о причинах смерти в государственной статистике о смертности населения;
• Повышение квалификации медицинских работников, оказывающих медицинскую помощь больным, путем: 
• определения характера патологических процессов на секционном, операционном и биопсийном материале;
• выявления на секционном, операционном и биопсийном материале острозаразных заболеваний;
• установления причины и механизма смерти больного с выявлением сущности и происхождения заболевания;
• совместного обсуждения с врачами - клиницистами результатов вскрытий и гистологических исследований и постоянной консультативной помощи в вопросах патологии.
• И другие.

Забор материала осуществляется в ходе оперативного вмешательства и специализированных процедур с использованием разных способов (открытый, пункционный, аспирационный, эндоскопический, трепанобиопсия). Подготовка проводится в соответствии с действующими требованиями к обозначенным манипуляциям.